ВАЗ-21099 Самара — модифікація ВАЗ-2109 з кузовом седан. Випускається з 1990 року.
Від інших моделей сімейства «Самара» ВАЗ-21099 відрізняла передня частина кузова з «довгими» крилами (на відміну від «коротких», з пластикової маскою в передній частині) та капотом, нова решітка радіатора, нова панель приладів. Згодом ці нововведення були перенесені на все сімейство «Самара».

Габаритна довжина ВАЗ-21099 по відношенню до інших автомобілів сімейства збільшилася на 200 мм за рахунок збільшення заднього схилу. Це дозволило не тільки розмістити багажний відсік, відокремлений від салону, а й забезпечити захист задній частині автомобіля від бруду (забризкування скла задніх дверей було неприємною особливістю ВАЗ-2108 і ВАЗ-2109).